Familial breast cancer and DNA repair genes: Insights into known and novel susceptibility genes from the GENESIS study, and implications for multigene panel testing
Elodie Girard
(1, 2)
,
Séverine Eon‐marchais
(1, 2)
,
Robert E Olaso
(3)
,
Anne‐laure Renault
(1, 2)
,
Francesca Damiola
(4)
,
Marie‐gabrielle Dondon
(1, 2)
,
Laure Barjhoux
(5)
,
Didier Goidin
(6)
,
Vincent Meyer
(7)
,
Dorothée Le Gal
(2, 1)
,
Juana Beauvallet
(2, 1)
,
Noura Mebirouk
(2, 1)
,
Christine Lonjou
(2, 1)
,
Juliette Coignard
(2, 1)
,
Morgane Marcou
(2, 1)
,
Eve Cavaciuti
(2, 1)
,
Céline Baulard
(3)
,
Marie‐thérèse Bihoreau
(3)
,
Odile Cohen‐haguenauer
(8)
,
Dominique Leroux
(9)
,
Clotilde Penet
(10)
,
Sandra Fert‐ferrer
(11)
,
Chrystelle Colas
(12, 13)
,
Thierry Frébourg
(14)
,
Francois Eisinger
(15)
,
Claude Adenis
(16)
,
Anne Fajac
(17)
,
Laurence Gladieff
(18)
,
Julie Tinat
(19)
,
Anne Floquet
(20)
,
Jean Chiesa
(21, 22)
,
Sophie Giraud
(23)
,
Isabelle Mortemousque
(24)
,
Florent Soubrier
(25)
,
Séverine Audebert‐bellanger
(26)
,
Jean‐marc Limacher
(27)
,
Christine C. Lasset
(28)
,
Sophie Lejeune‐dumoulin
(29)
,
Hélène Dreyfus
(30)
,
Yves‐jean Bignon
(31)
,
Michel Longy
(32)
,
Pascal Pujol
(33, 34)
,
Laurence Venat‐bouvet
(35)
,
Valerie V. Bonadona
(36)
,
Pascaline Berthet
(37)
,
Elisabeth Luporsi
(38)
,
Christine Maugard
(39)
,
Catherine Noguès
(40)
,
Capucine Delnatte
(41)
,
Jean‐pierre Fricker
(42)
,
Paul Gesta
(43)
,
Laurence Faivre
(44)
,
Alain Lortholary
(45)
,
Bruno Buecher
(46)
,
Olivier Caron
(47)
,
Marion Gauthier‐villars
(48)
,
Isabelle Coupier
(49)
,
Nicolas Servant
(1, 2)
,
Anne Boland
(3)
,
Sylvie Mazoyer
(50)
,
Jean‐françois Deleuze
(3)
,
Dominique Stoppa‐lyonnet
(13, 51)
,
Nadine N. Andrieu
(1, 2)
,
Fabienne Lesueur
(1, 2)
1
PSL -
Université Paris Sciences et Lettres
2 Cancer et génome: Bioinformatique, biostatistiques et épidémiologie d'un système complexe
3 CNG - Centre National de Génotypage
4 UNICANCER/CRCL - Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon
5 Unité Mixte de Génétique Constitutionnelle des Cancers Fréquents
6 Life Sciences and Diagnostics Group [Les Ulis, France]
7 I3M - Laboratoire Information, Milieux, Médias, Médiations - EA 3820
8 Hôpital Saint-Louis
9 TAMCIC - Traitement Algorithmique et Matériel de la Communication, de l'Information et de la Connaissance
10 CRLCC Jean Godinot
11 C.H.de Chambéry - Centre Hospitalier de Chambéry
12 CRSA - Centre de Recherche Saint-Antoine
13 Unité de Pharmacogénomique [Institut Curie]
14 Génétique médicale et fonctionnelle du cancer et des maladies neuropsychiatriques
15 SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD - Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale
16 UNICANCER/Lille - Centre Régional de Lutte contre le Cancer Oscar Lambret [Lille]
17 CHU Tenon [AP-HP]
18 ICR - Institut Claudius Regaud
19 Service de génétique [Rouen]
20 Département d'oncologie médicale
21 Laboratoire de Cytogénétique
22 IBMM - Institut des Biomolécules Max Mousseron [Pôle Chimie Balard]
23 Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL]
24 Service de génétique [Tours]
25 Génétique épidémiologique et moléculaire des pathologies cardiovasculaires
26 Laboratoire de Génétique Moléculaire et d'Histocompatibilité [Brest]
27 Hôpital pasteur [Colmar]
28 LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558
29 Hôpital Jeanne de Flandres
30 Institut Sainte Catherine [Avignon]
31 IMoST - Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques
32 Département de pathologie
33 Hôpital Arnaud de Villeneuve [CHU Montpellier]
34 IRCM - U1194 Inserm - UM - Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier
35 Hôpital Dupuytren [CHU Limoges]
36 Biostatistiques santé [LBBE]
37 Consultation d'Oncogénétique
38 CAV - Centre Alexis Vautrin
39 Laboratoire de Diagnostic Génétique [CHU Strasbourg]
40 CRLCC René Huguenin - CRLCC René Huguenin
41 CRLCC René Gauducheau
42 CRLCC Paul Strauss - Centre Paul Strauss
43 CH Georges Renon Niort - Centre Hospitalier Georges Renon [Niort]
44 GAD - Génétique des Anomalies du Développement
45 CCS - Centre Catherine-de-Sienne [Nantes]
46 Service de Génétique Oncologique
47 Onco-génétique
48 Institut Curie [Paris]
49 Unité d'Oncogénétique
50 CRNL - Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center
51 U830 - Unité de génétique et biologie des cancers
2 Cancer et génome: Bioinformatique, biostatistiques et épidémiologie d'un système complexe
3 CNG - Centre National de Génotypage
4 UNICANCER/CRCL - Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon
5 Unité Mixte de Génétique Constitutionnelle des Cancers Fréquents
6 Life Sciences and Diagnostics Group [Les Ulis, France]
7 I3M - Laboratoire Information, Milieux, Médias, Médiations - EA 3820
8 Hôpital Saint-Louis
9 TAMCIC - Traitement Algorithmique et Matériel de la Communication, de l'Information et de la Connaissance
10 CRLCC Jean Godinot
11 C.H.de Chambéry - Centre Hospitalier de Chambéry
12 CRSA - Centre de Recherche Saint-Antoine
13 Unité de Pharmacogénomique [Institut Curie]
14 Génétique médicale et fonctionnelle du cancer et des maladies neuropsychiatriques
15 SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD - Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale
16 UNICANCER/Lille - Centre Régional de Lutte contre le Cancer Oscar Lambret [Lille]
17 CHU Tenon [AP-HP]
18 ICR - Institut Claudius Regaud
19 Service de génétique [Rouen]
20 Département d'oncologie médicale
21 Laboratoire de Cytogénétique
22 IBMM - Institut des Biomolécules Max Mousseron [Pôle Chimie Balard]
23 Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL]
24 Service de génétique [Tours]
25 Génétique épidémiologique et moléculaire des pathologies cardiovasculaires
26 Laboratoire de Génétique Moléculaire et d'Histocompatibilité [Brest]
27 Hôpital pasteur [Colmar]
28 LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558
29 Hôpital Jeanne de Flandres
30 Institut Sainte Catherine [Avignon]
31 IMoST - Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques
32 Département de pathologie
33 Hôpital Arnaud de Villeneuve [CHU Montpellier]
34 IRCM - U1194 Inserm - UM - Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier
35 Hôpital Dupuytren [CHU Limoges]
36 Biostatistiques santé [LBBE]
37 Consultation d'Oncogénétique
38 CAV - Centre Alexis Vautrin
39 Laboratoire de Diagnostic Génétique [CHU Strasbourg]
40 CRLCC René Huguenin - CRLCC René Huguenin
41 CRLCC René Gauducheau
42 CRLCC Paul Strauss - Centre Paul Strauss
43 CH Georges Renon Niort - Centre Hospitalier Georges Renon [Niort]
44 GAD - Génétique des Anomalies du Développement
45 CCS - Centre Catherine-de-Sienne [Nantes]
46 Service de Génétique Oncologique
47 Onco-génétique
48 Institut Curie [Paris]
49 Unité d'Oncogénétique
50 CRNL - Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center
51 U830 - Unité de génétique et biologie des cancers
Elodie Girard
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1293913
- ORCID : 0000-0001-8737-5371
Séverine Eon‐marchais
- Fonction : Auteur
- PersonId : 905847
Vincent Meyer
- Fonction : Auteur
- PersonId : 944236
Chrystelle Colas
- Fonction : Auteur
- PersonId : 928992
Thierry Frébourg
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757398
- ORCID : 0000-0003-0399-4007
- IdRef : 074620916
Sophie Giraud
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1359982
- ORCID : 0000-0003-1243-3084
Florent Soubrier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 945017
Pascal Pujol
- Fonction : Auteur
- PersonId : 756985
- ORCID : 0000-0001-8315-4715
Christine Maugard
- Fonction : Auteur
- PersonId : 907549
- IdRef : 224466089
Catherine Noguès
- Fonction : Auteur
- PersonId : 21280
- IdHAL : catherine-nogues
- ORCID : 0000-0002-5768-6299
- IdRef : 030671175
Alain Lortholary
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1252273
- ORCID : 0000-0002-2585-6193
Nicolas Servant
- Fonction : Auteur
- PersonId : 918596
- ORCID : 0000-0003-1678-7410
Anne Boland
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757786
- ORCID : 0000-0001-8789-5676
Sylvie Mazoyer
- Fonction : Auteur
- PersonId : 752568
- IdHAL : sylvie-mazoyer
- ORCID : 0000-0002-2135-0160
- IdRef : 075600390
Fabienne Lesueur
Connectez-vous pour contacter l'auteur
- Fonction : Auteur correspondant
- PersonId : 1064009
Connectez-vous pour contacter l'auteur
Résumé
Pathogenic variants in BRCA1 and BRCA2 only explain the underlying genetic cause of about 10% of hereditary breast and ovarian cancer families. Because of cost-effectiveness, multigene panel testing is often performed even if the clinical utility of testing most of the genes remains questionable. The purpose of our study was to assess the contribution of rare, deleterious-predicted variants in DNA repair genes in familial breast cancer (BC) in a well-characterized and homogeneous population. We analyzed 113 DNA repair genes selected from either an exome sequencing or a candidate gene approach in the GENESIS study, which includes familial BC cases with no BRCA1 or BRCA2 mutation and having a sister with BC (N = 1,207), and general population controls (N = 1,199). Sequencing data were filtered for rare loss-of-function variants (LoF) and likely deleterious missense variants (MV). We confirmed associations between LoF and MV in PALB2, ATM and CHEK2 and BC occurrence. We also identified for the first time associations between FANCI, MAST1, POLH and RTEL1 and BC susceptibility. Unlike other associated genes, carriers of an ATM LoF had a significantly higher risk of developing BC than carriers of an ATM MV (ORLoF = 17.4 vs. ORMV = 1.6; p Het = 0.002). Hence, our approach allowed us to specify BC relative risks associated with deleterious-predicted variants in PALB2, ATM and CHEK2 and to add MAST1, POLH, RTEL1 and FANCI to the list of DNA repair genes possibly involved in BC susceptibility. We also highlight that different types of variants within the same gene can lead to different risk estimates.
Fichier principal
Girard_et_al-2019-International_Journal_of_Cancer.pdf (834.22 Ko)
Télécharger le fichier
| Origine | Publication financée par une institution |
|---|
Loading...