Characterization of cell-fate decision landscapes by estimating transcription factor dynamics - Inserm - Institut national de la santé et de la recherche médicale
Article Dans Une Revue (Data Paper) Cell Reports Methods Année : 2023

Characterization of cell-fate decision landscapes by estimating transcription factor dynamics

Résumé

Highlights d FateCompass is an integrative pipeline to estimate TF activity dynamics d FateCompass learns trajectories using RNA velocity or a differentiation potential d FateCompass reveals known and novel regulators in pancreatic datasets d Lineage tracing validates FateCompass predictions for in vitro b cell differentiation
Fichier principal
Vignette du fichier
mmc4-2.pdf (17.34 Mo) Télécharger le fichier
Origine Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

inserm-04140681 , version 1 (26-06-2023)

Identifiants

Citer

Sara Jiménez, Valérie Schreiber, Reuben Mercier, Gérard Gradwohl, Nacho Molina. Characterization of cell-fate decision landscapes by estimating transcription factor dynamics. Cell Reports Methods, 2023, pp.100512. ⟨10.1016/j.crmeth.2023.100512⟩. ⟨inserm-04140681⟩
211 Consultations
91 Téléchargements

Altmetric

Partager

More